keyhacのMac版いつも使っているKarabiner(https://pqrs.org/osx/karabiner/index.html.ja)がEl Capitanではまだ動かないということなので、 このkeyhacを試してみたところ、動くようです。ただ、細かいところでは、違うところがあるので設定を見ないといけないようです。
http://www.sakashita-net.jp/2015/10/keyhacmac.html
Mac OS X用keyhacと、その設定は以下にあります。
Keyhac - Pythonによる柔軟なキーカスタマイズツール
https://sites.google.com/site/craftware/keyhac-ja
Windows の操作を emacs のキーバインドで行うための設定 （Keyhac版）
https://www49.atwiki.jp/ntemacs/pages/25.html
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<2017/03/10 追記>
本設定をカスタマイズして Mac版を公開された方がいらっしゃいます。私は Mac を使わないので使用感が分からないのですが、Mac をお使いの方は是非お試しください。
https://github.com/hiroxy/keyhac-config
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